シュードモナス科

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シュードモナス科
血液寒天培地上の緑膿菌Pseudomonas aeruginosa)のコロニー
UVライト下で蛍光を呈するシュードモナス・フルオレッセンスPseudomonas fluorescens
分類
ドメイン : 真正細菌
Bacteria
: プロテオバクテリア門
Proteobacteria
: ガンマプロテオバクテリア綱
Gammaproteobacteria
: シュードモナス目
Pseudomonadales
: シュードモナス科
Pseudomonadaceae
学名
Pseudomonadaceae
Winslow et al. 1917[1]
(IJSEMリストに掲載 1980[2])
タイプ属
シュードモナス属
Pseudomonas

Migula 1894[3]
(IJSEMリストに掲載 1980[2])
シノニム
  • アゾトバクター科
    Azotobacteraceae

    Pribram 1933[4]
    (IJSEMリストに掲載 1980[2])
下位分類([23]

シュードモナス科(ーか、Pseudomonadaceae)とは真性細菌の一つである。

歴史[編集]

シュードモナス菌Pseudomonadはギリシャ語のpseudo (ψευδο - 偽の)とmonos (μονος - 一団)との成語であり、直訳で「偽の一団」の意味である。"monad"は微生物学の初期から用いられてきた用語であり、単細胞生物を指す。シュードモナス菌は普遍的に存在する微生物であるため、微生物学の初期からその存在を認識されており、研究されてきた。シュードモナス属という語は1894年に登場した。当時は、グラム陰性で桿状かつ胞子生産性の細菌という非常に漠然とした定義であった。シュードモナス菌は膨大な種類のニッチから単離され、非常に多くの種がシュードモナス属に分類されることになった。種の振り分けが見直され、新たに制定された分類法と、生体高分子核酸タンパク質)に基づく手法により多くの種は再分類された。

Azotobacteriaceae科は2004年にこの科に統合された[24]

2000年にシュードモナス属の複数の種について完全ゲノムシークエンシングが行われた。以降、P. aeruginosa PAO1 (2000)やP. putida KT2440 (2002)、P. fluorescens Pf-5 (2005)、P. fluorescens PfO-1、P. entomophila L48についても完全ゲノムの解読がなされた。Pseudomonas syringaeの植物病原種 ― pathovar tomato DC3000 (2003)やpathovar syringae B728a (2005)、pathovar phaseolica 1448A (2005) ― のシークエンシングも行われた。

特性[編集]

  • シトクロムCオキシダーゼを有するため、オキシダーゼ陽性
  • 非発酵性
  • グリセルアルデヒド6リン酸脱水素酵素とアルドラーゼによるエントナー・ドゥドロフ経路を有するため、グルコース代謝能を持つ。
  • 胞子産生性でかつ運動性を示す。
  • 多くの種が蛍光色素のピヨベルジンを産生する[25]

オキシダーゼ活性と胞子産生性、発酵不活性である点が、同じガンマプロテオバクテリア綱腸内細菌科と異なる[26]

脚注[編集]

  1. ^ C.-E. A. Winslow, Jean Broadhurst, R. E. Buchanan, Charles Krumwiede, Jr., L. A. Rogers, George H. (1 September 1917). “The Families and Genera of the Bacteria: Preliminary Report of the Committee of the Society of American Bacteriologists on Characterization and Classification of Bacterial Types”. Journal of Bacteriology 2 (5): 505-66. PMC 378727. PMID 16558764. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC378727/. 
  2. ^ a b c d e f V. B. D. Skerman, Vicki. McGOWAN and P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1): 225-420. doi:10.1099/00207713-30-1-225. 
  3. ^ a b Migula W. (1894). “Arbeiten aus dem Bakteriologischen Institut der Technischen Hochschule zu Karlsruhe”. Über ein neues System der Bakterien 1: 235-238. 
  4. ^ Pribram E. (1933). “F. Deuticke”. Klassification der Schizomyceten. 
  5. ^ a b Bashudev Rudra and Radhey S. Gupta (21 September 2021). “Phylogenomic and comparative genomic analyses of species of the family Pseudomonadaceae: Proposals for the genera Halopseudomonas gen. nov. and Atopomonas gen. nov., merger of the genus Oblitimonas with the genus Thiopseudomonas, and transfer of some misclassified species of the genus Pseudomonas into other genera”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (9). doi:10.1099/ijsem.0.005011. PMID 34546867. 
  6. ^ a b Aharon Oren and George M. Garrity (20 December 2021). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 71, part 9 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (12): 5130. doi:10.1099/ijsem.0.005130. 
  7. ^ Winogradsky S. (1938). Sur la morphologie et l'écologie des Azotobacter. “Études sur la microbiologie du sol et des eaux”. Annales de l'Institut Pasteur (Paris) 60: 351-400. 
  8. ^ Thompson JP, Skerman (1979). “VBD. Azotobacteraceae: the taxonomy and ecology of the aerobic nitrogen-fixing bacteria”. Academic Press. 
  9. ^ “Validation of the Publication of New Names and New Combinations Previously Effectively Published Outside the IJSB: List No. 6”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 31 (2): 215-218. (01 April 1981). doi:10.1099/00207713-31-2-215. 
  10. ^ Beijerinck MW (1901). “Über oligonitrophile Mikroben”. Zentralblatt für Bakteriologie, Parasitenkunde, Infektionskrankheiten und Hygiene. Abteilung II 7: 561-582. 
  11. ^ B. Holmes, A. G. Steigerwalt, R. E. Weaver and Don J. Brenner (01 April 1986). “Chryseomonas polytricha gen. nov., sp. nov., a Pseudomonas-Like Organism from Human Clinical Specimens and Formerly Known as Group Ve-1”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 36 (2): 161-165. doi:10.1099/00207713-36-2-161. 
  12. ^ Zaki Saati-Santamaría, Ezequiel Peral-Aranega, Encarna Velázquez, Raúl Rivas, Paula García-Fraile (3 August 2021). “Phylogenomic Analyses of the Genus Pseudomonas Lead to the Rearrangement of Several Species and the Definition of New Genera”. Biology 10 (8). doi:10.3390/biology10080782. PMC 8389581. PMID 34440014. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8389581/. 
  13. ^ Aharon Oren and George M. Garrity (01 December 2021). “Valid publication of new names and new combinations effectively published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (11): 5096. doi:10.1099/ijsem.0.005096. 
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  20. ^ International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology: 179-180. doi:10.1099/00207713-37-2-179. 
  21. ^ Wen-Bo Tan, Zhao Jiang, Chuan Chen, Ye Yuan, Ling-Fang Gao, Hong-Fei Wang, Juan Cheng, Wen-Jun Li, Ai-Jie Wang (01 January 2015). “Thiopseudomonas denitrificans gen. nov., sp. nov., isolated from anaerobic activated sludge”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_1): 225-229. doi:10.1099/ijs.0.064634-0. PMID 25326445. 
  22. ^ Aharon Oren and George M. Garrity (01 April 2015). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 65, part 1, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_4): 1112-1113. doi:10.1099/ijs.0.000096. 
  23. ^ Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte. “Family Pseudomonadaceae”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2024年5月2日閲覧。
  24. ^ Rediers H, Vanderleyden J, De Mot R (2004). “Azotobacter vinelandii: a Pseudomonas in disguise?”. Microbiology 150 (Pt 5): 1117–9. doi:10.1099/mic.0.27096-0. PMID 15133068. 
  25. ^ Meyer J (2000). “Pyoverdines: pigments, siderophores and potential taxonomic markers of fluorescent Pseudomonas species”. Arch Microbiol 174 (3): 135–42. doi:10.1007/s002030000188. PMID 11041343. 
  26. ^ Williams & Wilkins (1984). Krieg, N.R.. ed. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume 1. ISBN 0-683-04108-8